一、标题
基于深度学习的蛋白质结构预测
二、主讲人
杨建益 南开大学数学科学学院
三、摘要
蛋白质结构预测的目标是从蛋白质的氨基酸序列出发,通过算法设计和开发,构建准确的三维结构模型。本报告中,我将介绍近年来我们在蛋白质结构预测领域的主要工作trRosetta。它主要包括两部分:(1)通过深度学习算法预测蛋白质残基间的几何信息;(2)把这些信息转化为Rosetta的能量项,通过能量最小化方法快速从头预测蛋白质结构。最后,我将简单讨论DeepMind团队最近公布的AlphaFold2。
四、时间
2021.01.04 16:00 - 17:00
五、地点
华岗苑东楼119报告厅
六、主讲人简介
杨建益,南开大学教授、博士生导师。2011年博士毕业于新加坡南洋理工大学,2011-2014在美国密歇根大学从事博士后研究。2018年获得霍英东教育基金会青年教师基金。通过与Yang Zhang和David Baker等学者的合作,成功开发了I-TASSER、trRosetta和COACH等著名算法,在Nature Methods、PNAS等期刊发表SCI论文40多篇,被SCI他引4000多次,5篇论文入选ESI高被引论文。详情请见课题组网站:http://yanglab.nankai.edu.cn/.