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山东大学报

学术预告

基于深度学习的蛋白质结构预测

发布:山东大学融媒体中心 日期:2021年01月02日

一、标题

基于深度学习的蛋白质结构预测

二、主讲人

杨建益 南开大学数学科学学院

三、摘要

蛋白质结构预测的目标是从蛋白质的氨基酸序列出发,通过算法设计和开发,构建准确的三维结构模型。本报告中,我将介绍近年来我们在蛋白质结构预测领域的主要工作trRosetta。它主要包括两部分:(1)通过深度学习算法预测蛋白质残基间的几何信息;(2)把这些信息转化为Rosetta的能量项,通过能量最小化方法快速从头预测蛋白质结构。最后,我将简单讨论DeepMind团队最近公布的AlphaFold2。

四、时间

2021.01.04 16:00 - 17:00

五、地点

华岗苑东楼119报告厅

六、主讲人简介

杨建益,南开大学教授、博士生导师。2011年博士毕业于新加坡南洋理工大学,2011-2014在美国密歇根大学从事博士后研究。2018年获得霍英东教育基金会青年教师基金。通过与Yang Zhang和David Baker等学者的合作,成功开发了I-TASSER、trRosetta和COACH等著名算法,在Nature Methods、PNAS等期刊发表SCI论文40多篇,被SCI他引4000多次,5篇论文入选ESI高被引论文。详情请见课题组网站:http://yanglab.nankai.edu.cn/.


【供稿单位:数学与交叉科学研究中心     作者:杨媛    责任编辑:蒋晓涵】